Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms