Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BICD1Q96G01 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms