Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms