Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms