Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms