Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms