Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms