Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms