Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms