Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms