Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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