Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms