Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINGO4Q6UY18 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINGO4Q6UY18 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms