Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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