Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms