Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms