Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF6Q330K2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms