Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms