Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms