Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MICAQ29983 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MICAQ29983 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms