Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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