Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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