Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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