Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
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