Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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