Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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