Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms