Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms