Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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