Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms