Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms