Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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