Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBR1Q14596 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NBR1Q14596 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBR1Q14596 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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