Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms