Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMB3Q13751 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms