Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms