Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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