Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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