Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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