Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATMQ13315 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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