Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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