Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms