Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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