Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms