Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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