Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms