Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms