Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms