Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms