Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms